High Throughput Screening in vivo sur embryons de poissons zèbres
Abstract
L’objectif du projet est d’automatiser les analyses in vivo faites habituellement á la main par les chercheurs biologistes. La mise en place d’un tel système pourrait accélérer considérablement le développement des nouveaux traitements pharmaceutiques, en réduisant notamment la durée de la phase pré-clinique. Concrètement, il s’agit dans notre cas, d’utiliser des embryons de poissons zèbres exprimant une protéine de fluorescence (GFP) ; ceci permet d’observer les organes grâce à un microscope à fluorescence, et dans notre cas en particulier son cœur. A partir d’une vidéo du cœur, il s´agit de détecter et classifier différents phénotypes morphologiques et fonctionnels (morphologie cardiaque, volume des cavités cardiaques, fréquence cardiaque, arythmie cardiaque, etc.) grâce à des méthodes d’analyse et de traitement d’image avancées. En réalisant des expérimentations à grande échelle, on peut alors fournir des données statistiques sur les effets (bénéfiques ou néfastes) de telle ou telle substance sur le cœur de poisson zèbre.
BIB_text
@Article {
author = {Nicolas Collin},
title = {High Throughput Screening in vivo sur embryons de poissons zèbres},
keywds = {
video analysis, dynamic in-vivo microscopy, heart rate, living embryo.
}
abstract = {
L’objectif du projet est d’automatiser les analyses in vivo faites habituellement á la main par les chercheurs biologistes. La mise en place d’un tel système pourrait accélérer considérablement le développement des nouveaux traitements pharmaceutiques, en réduisant notamment la durée de la phase pré-clinique. Concrètement, il s’agit dans notre cas, d’utiliser des embryons de poissons zèbres exprimant une protéine de fluorescence (GFP) ; ceci permet d’observer les organes grâce à un microscope à fluorescence, et dans notre cas en particulier son cœur. A partir d’une vidéo du cœur, il s´agit de détecter et classifier différents phénotypes morphologiques et fonctionnels (morphologie cardiaque, volume des cavités cardiaques, fréquence cardiaque, arythmie cardiaque, etc.) grâce à des méthodes d’analyse et de traitement d’image avancées. En réalisant des expérimentations à grande échelle, on peut alors fournir des données statistiques sur les effets (bénéfiques ou néfastes) de telle ou telle substance sur le cœur de poisson zèbre.
}
date = {2007-02-01},
year = {2007},
}
author = {Nicolas Collin},
title = {High Throughput Screening in vivo sur embryons de poissons zèbres},
keywds = {
video analysis, dynamic in-vivo microscopy, heart rate, living embryo.
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abstract = {
L’objectif du projet est d’automatiser les analyses in vivo faites habituellement á la main par les chercheurs biologistes. La mise en place d’un tel système pourrait accélérer considérablement le développement des nouveaux traitements pharmaceutiques, en réduisant notamment la durée de la phase pré-clinique. Concrètement, il s’agit dans notre cas, d’utiliser des embryons de poissons zèbres exprimant une protéine de fluorescence (GFP) ; ceci permet d’observer les organes grâce à un microscope à fluorescence, et dans notre cas en particulier son cœur. A partir d’une vidéo du cœur, il s´agit de détecter et classifier différents phénotypes morphologiques et fonctionnels (morphologie cardiaque, volume des cavités cardiaques, fréquence cardiaque, arythmie cardiaque, etc.) grâce à des méthodes d’analyse et de traitement d’image avancées. En réalisant des expérimentations à grande échelle, on peut alors fournir des données statistiques sur les effets (bénéfiques ou néfastes) de telle ou telle substance sur le cœur de poisson zèbre.
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date = {2007-02-01},
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