Sistema avanzado de estratificación basado en datos genómicos e inteligencia artificial

En el proyecto ESTRATAGENIA se ha desarrollado una plataforma para procesar datos clínicos y genómicos mediante machine learning. La plataforma permite el uso de datos propios como de datos del repositorio The Cancer Genome Atlas (TCGA), que se descargan utilizando la plataforma desarrollada. The Cancer Genome Atlas es un proyecto de genómica del cáncer, donde se han caracterizado molecularmente más de 20,000 cánceres primarios que abarcan 33 tipos de cáncer y contiene más de 2.5 petabytes de datos genómicos, epigenómicos, transcriptómicos y proteómicos.
Mediante la plataforma se pueden visualizar y procesar utilizando técnicas de machine learning tanto datos clínicos como genómicos. Una vez desarrollado el modelo de machine learning se pueden estratificar o clasificar a los pacientes en base a esta información. Se han implementado algoritmos de árboles de decisión que nos permiten, por un lado, extraer las características de un dataset y en base a esas características, estudiar el resultado de un paciente concreto.